中国基督教三自爱国运动委员会与中国基督教协会合称 “中国基督教两会”或“基督教全国两会”。

1950年，吴耀宗等中国教会先辈满怀对新中国的憧憬，发表《中国基督教在新中国建设中努力的途径》（通称《三自宣言》），发起三自革新运动，为了“促成一个为中国人自己所主持的教会”，得到了全国基督徒的热烈响应和拥护。

1954年，中国基督教第一次全国会议在北京胜利召开，正式成立了中国基督教三自爱国运动委员会（简称“全国三自”，英译名为National Committee of Three-Self Patriotic Movement of the Protestant Church in China，缩写为“National TSPM”）。全国三自是中国基督徒的爱国爱教组织。

1979年，中国教会重新开放，恢复活动。1980年，中国基督教第三次全国会议在南京胜利召开，成立了中国基督教协会（简称“全国基协”，英译名为China Christian Council，缩写为“CCC”）。全国基协是中国基督教全国性教务组织。

中国基督教两会拥护中国共产党的领导，拥护社会主义制度，弘扬爱国主义精神，遵守宪法、法律、法规和国家政策，践行社会主义核心价值观；坚持自治、自养、自传的三自原则，独立自主自办教会，走爱国爱教、荣神益人的道路；积极开展神学思想建设，系统推进我国基督教中国化；制订和完善教会规章制度，依法依规办教，落实全面从严治教；实行联合礼拜，主张在信仰观点和礼仪上互相尊重，努力“完完全全地合而为一”；增强教内外团结，带领全国基督徒为全面建设社会主义现代化国家、以中国式现代化全面推进中华民族伟大复兴而团结奋斗。

中国基督教两会的最高权力机构是中国基督教代表会议，每五年举行一次，负责审议常务委员会工作报告，选举新一届全国三自主席、副主席、秘书长；全国基协会长、副会长、总干事。本届基督教全国两会设7个工作部门和10个专门委员会。全国三自和全国基协分工合作，共同做好中国基督教的各项事工，为办好中国教会服务。

金陵协和神学院是中国基督教两会主办的唯一一所全国性神学院。圣三一堂是中国基督教两会的直属堂。

中国基督教两会会址设于上海市黄浦区九江路219号（邮编200002）。